20260811-欧洲疾病预防控制中心-肺炎链球菌的鉴定_抗菌药物敏感性试验和分子分型外部质量评估_2026_27页_2mb

肺炎链球菌鉴定、抗菌药物敏感性试验和分子分型外部质量评估（2026）

核心内容

本报告由欧洲疾病预防控制中心（ECDC）委托，由IBDLabNet联盟制作，旨在评估欧盟/欧洲经济区（EU/EEA）实验室在非培养和培养环境下对肺炎链球菌的检测、鉴定、血清分型和抗菌药物敏感性试验（AST）的性能表现。同时，也评估了全基因组测序（WGS）的使用情况和报告结果。

主要观点

• 基于培养的鉴定与分型表现良好：所有实验室均正确鉴定了肺炎链球菌分离株P1和P2，血清型分型结果一致性高，尤其是P2样本。
• 非培养样本的鉴定准确率高：NC3和NC5样本的肺炎链球菌鉴定正确率均为90.3%，但血清型报告完整性较低。
• AST方法异质性较大：实验室在抗生素敏感性测试中使用多种方法，如E-test、肉汤微稀释法等，且报告率较高。
• WGS实施程度适中：约47.8%的实验室对分离株进行了WGS，且序列类型报告完整，但LINcode报告不完整。
• 存在主要差距：非培养样本的血清型报告不完整，影响了血清型信息的可比性和监测价值。

关键信息

参与情况与实验室方法

• 共有来自24个国家的34个实验室参与了本次EQA活动。
• 所有实验室都收到了非培养检测面板，其中32个实验室提交了结果。
• 24个实验室申请了培养检测面板，其中23个提供了可分析的分离株数据。

非培养样本性能表现

• NC3样本：

  • 正确病原体鉴定：28/31（90.3%）。
  • 正确血清型报告：7/8（87.5%）。
  • 血清型Ct值：30.6。
  • 物种Ct值中位数：31.75（IQR: 30.3–36.14）。

• NC5样本：

  • 正确病原体鉴定：28/31（90.3%）。
  • 正确血清型报告：6/7（85.7%）。
  • 血清型Ct值：34.9。
  • 物种Ct值中位数：34.0（IQR: 30.6–35.0）。

培养分离株性能表现

• P1样本：

  • 正确病原体鉴定：23/23（100.0%）。
  • 正确血清型报告：19/21（90.5%）。
  • MIC测试报告率：21/23（91.3%）。

• P2样本：

  • 正确病原体鉴定：23/23（100.0%）。
  • 正确血清型报告：21/21（100.0%）。
  • MIC测试报告率：20/23（87.0%）。

抗菌药物敏感性试验（AST）结果

• P1样本：

  • 青霉素：17/18（94.4%）在1倍稀释范围内一致。
  • 氨苄西林：7/14（50.0%）。
  • 头孢他啶：17/19（89.5%）。
  • 头孢曲松：10/12（83.3%）。
  • 阿奇霉素：2/3（66.7%）。
  • 四环素：7/11（63.6%）。

• P2样本：

  • 青霉素：16/17（94.1%）。
  • 氨苄西林：11/14（78.6%）。
  • 头孢他啶：16/18（88.9%）。
  • 头孢曲松：7/12（58.3%）。
  • 阿奇霉素：3/5（60.0%）。
  • 四环素：6/11（54.5%）。

全基因组测序（WGS）采用情况

• WGS报告率：11/23（47.8%）。
• 测序平台：Illumina为最常用（81.8%）。
• 序列类型报告完整性：100%。
• LINcode报告完整性：72.7%。
• WGS的标准化不足：需进一步协调和统一报告框架。

结论与建议

结论

• 培养环境下的肺炎链球菌检测和分型表现良好。
• 非培养样本的病原体鉴定准确，但血清型报告完整性不足。
• AST和WGS在部分实验室中实施，但存在方法异质性和报告不一致问题。

建议

1. 改进非培养样本血清型报告的完整性和一致性。
2. 收集更多结构化的方法学信息，以支持结果解释。
3. 加强血清型报告的协调，特别是针对疫苗和非疫苗血清型。
4. 保持标准化的AST报告，包括原始MIC值和解释标准。
5. 进一步协调WGS的报告框架，以提高数据可比性。
6. 提高未来EQA的学术价值，包含更多挑战性材料，如阴性样本和低信号样本。
7. 使用EQA结果进行反馈和培训，以提升整体能力。

附件概述

• 附件1：参与实验室与国家列表。
• 附件2：肺炎链球菌面板组成及预期结果。
• 附件3：详细结果表格，包括病原体鉴定、血清型、MIC测试和WGS数据。

此总结基于2026年肺炎链球菌外部质量评估报告，涵盖了实验设计、结果分析、讨论及建议等核心内容，旨在为公共卫生监测提供数据支持和方法改进方向。